Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Washc4Q3UMB9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Washc4Q3UMB9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Washc4Q3UMB9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Washc4Q3UMB9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Washc4Q3UMB9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Washc4Q3UMB9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Washc4Q3UMB9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Washc4Q3UMB9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Washc4Q3UMB9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Washc4Q3UMB9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Washc4Q3UMB9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Washc4Q3UMB9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Washc4Q3UMB9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Washc4Q3UMB9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Washc4Q3UMB9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Washc4Q3UMB9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Washc4Q3UMB9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Washc4Q3UMB9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Washc4Q3UMB9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Washc4Q3UMB9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Washc4Q3UMB9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Washc4Q3UMB9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Washc4Q3UMB9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Washc4Q3UMB9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Washc4Q3UMB9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Washc4Q3UMB9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Washc4Q3UMB9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Washc4Q3UMB9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms