Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx6-3Q3UHX8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx6-3Q3UHX8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx6-3Q3UHX8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx6-3Q3UHX8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx6-3Q3UHX8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms