Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC2

Lrrk1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrk1Q3UHC2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrk1Q3UHC2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrk1Q3UHC2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrk1Q3UHC2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrk1Q3UHC2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrk1Q3UHC2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrk1Q3UHC2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrk1Q3UHC2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrk1Q3UHC2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrk1Q3UHC2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms