Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hectd3Q3U487 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hectd3Q3U487 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hectd3Q3U487 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hectd3Q3U487 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hectd3Q3U487 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms