Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp25Q3U435 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp25Q3U435 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp25Q3U435 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp25Q3U435 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp25Q3U435 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp25Q3U435 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp25Q3U435 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms