Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ogfod1Q3U0K8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ogfod1Q3U0K8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ogfod1Q3U0K8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ogfod1Q3U0K8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ogfod1Q3U0K8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ogfod1Q3U0K8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ogfod1Q3U0K8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ogfod1Q3U0K8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ogfod1Q3U0K8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ogfod1Q3U0K8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ogfod1Q3U0K8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ogfod1Q3U0K8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ogfod1Q3U0K8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ogfod1Q3U0K8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ogfod1Q3U0K8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms