Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Smyd5Q3TYX3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Smyd5Q3TYX3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Smyd5Q3TYX3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Smyd5Q3TYX3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Smyd5Q3TYX3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Smyd5Q3TYX3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Smyd5Q3TYX3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Smyd5Q3TYX3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Smyd5Q3TYX3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Smyd5Q3TYX3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Smyd5Q3TYX3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Smyd5Q3TYX3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Smyd5Q3TYX3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Smyd5Q3TYX3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Smyd5Q3TYX3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms