Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smyd5Q3TYX3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smyd5Q3TYX3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smyd5Q3TYX3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smyd5Q3TYX3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smyd5Q3TYX3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smyd5Q3TYX3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smyd5Q3TYX3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smyd5Q3TYX3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smyd5Q3TYX3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smyd5Q3TYX3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smyd5Q3TYX3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smyd5Q3TYX3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smyd5Q3TYX3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smyd5Q3TYX3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smyd5Q3TYX3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms