Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Fubp3Q3TIX6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fubp3Q3TIX6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fubp3Q3TIX6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fubp3Q3TIX6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fubp3Q3TIX6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fubp3Q3TIX6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fubp3Q3TIX6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fubp3Q3TIX6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fubp3Q3TIX6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fubp3Q3TIX6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fubp3Q3TIX6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fubp3Q3TIX6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fubp3Q3TIX6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms