Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccbe1Q3MI99 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccbe1Q3MI99 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccbe1Q3MI99 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccbe1Q3MI99 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccbe1Q3MI99 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms