Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lingo4Q149C3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lingo4Q149C3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lingo4Q149C3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lingo4Q149C3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lingo4Q149C3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lingo4Q149C3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lingo4Q149C3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms