Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smim24Q0VG18 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smim24Q0VG18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smim24Q0VG18 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smim24Q0VG18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smim24Q0VG18 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim24Q0VG18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim24Q0VG18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms