Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NeblQ0II04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NeblQ0II04 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NeblQ0II04 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NeblQ0II04 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NeblQ0II04 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeblQ0II04 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NeblQ0II04 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms