Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calb2Q08331 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Calb2Q08331 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calb2Q08331 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calb2Q08331 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calb2Q08331 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calb2Q08331 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calb2Q08331 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calb2Q08331 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 285.5 ms