Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CluQ06890 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CluQ06890 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CluQ06890 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CluQ06890 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CluQ06890 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CluQ06890 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CluQ06890 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CluQ06890 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CluQ06890 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CluQ06890 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CluQ06890 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CluQ06890 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CluQ06890 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CluQ06890 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CluQ06890 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CluQ06890 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CluQ06890 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CluQ06890 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CluQ06890 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CluQ06890 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CluQ06890 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CluQ06890 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CluQ06890 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CluQ06890 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CluQ06890 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CluQ06890 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CluQ06890 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CluQ06890 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CluQ06890 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CluQ06890 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CluQ06890 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CluQ06890 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CluQ06890 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CluQ06890 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CluQ06890 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CluQ06890 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CluQ06890 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CluQ06890 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CluQ06890 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CluQ06890 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CluQ06890 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CluQ06890 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CluQ06890 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CluQ06890 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CluQ06890 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CluQ06890 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CluQ06890 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CluQ06890 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CluQ06890 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CluQ06890 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CluQ06890 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CluQ06890 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CluQ06890 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CluQ06890 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CluQ06890 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CluQ06890 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CluQ06890 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CluQ06890 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CluQ06890 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CluQ06890 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CluQ06890 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CluQ06890 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CluQ06890 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CluQ06890 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CluQ06890 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CluQ06890 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CluQ06890 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CluQ06890 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CluQ06890 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CluQ06890 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CluQ06890 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CluQ06890 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CluQ06890 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CluQ06890 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CluQ06890 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CluQ06890 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CluQ06890 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CluQ06890 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CluQ06890 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CluQ06890 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CluQ06890 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CluQ06890 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CluQ06890 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CluQ06890 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CluQ06890 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CluQ06890 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CluQ06890 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CluQ06890 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms