Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp2Q06649 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp2Q06649 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sh3bp2Q06649 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp2Q06649 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3bp2Q06649 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp2Q06649 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp2Q06649 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp2Q06649 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp2Q06649 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp2Q06649 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp2Q06649 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp2Q06649 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp2Q06649 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp2Q06649 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp2Q06649 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp2Q06649 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms