Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Fmn1Q05860 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Fmn1Q05860 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Fmn1Q05860 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Fmn1Q05860 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Fmn1Q05860 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Fmn1Q05860 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Fmn1Q05860 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Fmn1Q05860 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Fmn1Q05860 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Fmn1Q05860 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Fmn1Q05860 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Fmn1Q05860 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Fmn1Q05860 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Fmn1Q05860 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Fmn1Q05860 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Fmn1Q05860 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Fmn1Q05860 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Fmn1Q05860 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Fmn1Q05860 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Fmn1Q05860 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Fmn1Q05860 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Fmn1Q05860 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Fmn1Q05860 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Fmn1Q05860 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Fmn1Q05860 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Fmn1Q05860 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Fmn1Q05860 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Fmn1Q05860 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Fmn1Q05860 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Fmn1Q05860 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Fmn1Q05860 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Fmn1Q05860 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Fmn1Q05860 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Fmn1Q05860 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Fmn1Q05860 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Fmn1Q05860 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Fmn1Q05860 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Fmn1Q05860 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Fmn1Q05860 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Fmn1Q05860 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Fmn1Q05860 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Fmn1Q05860 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Fmn1Q05860 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
Fmn1Q05860 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Fmn1Q05860 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Fmn1Q05860 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Fmn1Q05860 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Fmn1Q05860 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Fmn1Q05860 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Fmn1Q05860 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Fmn1Q05860 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Fmn1Q05860 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Fmn1Q05860 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Fmn1Q05860 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Fmn1Q05860 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
Fmn1Q05860 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Fmn1Q05860 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Fmn1Q05860 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Fmn1Q05860 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms