Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rcn1Q05186 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rcn1Q05186 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rcn1Q05186 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rcn1Q05186 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rcn1Q05186 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rcn1Q05186 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rcn1Q05186 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rcn1Q05186 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rcn1Q05186 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rcn1Q05186 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rcn1Q05186 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rcn1Q05186 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rcn1Q05186 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rcn1Q05186 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rcn1Q05186 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms