Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoc2Q05020 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoc2Q05020 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoc2Q05020 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoc2Q05020 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apoc2Q05020 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoc2Q05020 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoc2Q05020 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apoc2Q05020 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms