Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RelaQ04207 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RelaQ04207 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RelaQ04207 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RelaQ04207 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RelaQ04207 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RelaQ04207 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RelaQ04207 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RelaQ04207 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RelaQ04207 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RelaQ04207 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RelaQ04207 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RelaQ04207 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RelaQ04207 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RelaQ04207 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RelaQ04207 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RelaQ04207 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RelaQ04207 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RelaQ04207 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RelaQ04207 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RelaQ04207 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RelaQ04207 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RelaQ04207 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RelaQ04207 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RelaQ04207 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RelaQ04207 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms