Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col6a2Q02788 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col6a2Q02788 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col6a2Q02788 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col6a2Q02788 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col6a2Q02788 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col6a2Q02788 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col6a2Q02788 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col6a2Q02788 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col6a2Q02788 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col6a2Q02788 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms