Protein–RNA interactions for Protein: Q01147

Creb1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb1Q01147 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Creb1Q01147 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Creb1Q01147 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Creb1Q01147 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Creb1Q01147 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Creb1Q01147 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Creb1Q01147 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Creb1Q01147 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Creb1Q01147 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb1Q01147 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Creb1Q01147 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Creb1Q01147 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Creb1Q01147 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Creb1Q01147 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Creb1Q01147 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Creb1Q01147 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Creb1Q01147 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 547.2 ms