Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gabpb1Q00420 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gabpb1Q00420 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabpb1Q00420 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabpb1Q00420 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabpb1Q00420 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabpb1Q00420 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabpb1Q00420 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabpb1Q00420 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabpb1Q00420 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb1Q00420 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb1Q00420 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb1Q00420 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb1Q00420 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabpb1Q00420 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabpb1Q00420 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabpb1Q00420 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabpb1Q00420 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabpb1Q00420 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabpb1Q00420 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabpb1Q00420 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabpb1Q00420 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb1Q00420 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms