Protein–RNA interactions for Protein: Q00196

Pou2f2, POU domain, class 2, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f2Q00196 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pou2f2Q00196 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pou2f2Q00196 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pou2f2Q00196 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pou2f2Q00196 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pou2f2Q00196 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pou2f2Q00196 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pou2f2Q00196 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pou2f2Q00196 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pou2f2Q00196 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pou2f2Q00196 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pou2f2Q00196 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pou2f2Q00196 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pou2f2Q00196 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pou2f2Q00196 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pou2f2Q00196 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pou2f2Q00196 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pou2f2Q00196 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pou2f2Q00196 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pou2f2Q00196 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pou2f2Q00196 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pou2f2Q00196 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pou2f2Q00196 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms