Protein–RNA interactions for Protein: P97772

Grm1, Metabotropic glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grm1P97772 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grm1P97772 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grm1P97772 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grm1P97772 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grm1P97772 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grm1P97772 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grm1P97772 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grm1P97772 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grm1P97772 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grm1P97772 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grm1P97772 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grm1P97772 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grm1P97772 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grm1P97772 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grm1P97772 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grm1P97772 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grm1P97772 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grm1P97772 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Grm1P97772 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grm1P97772 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grm1P97772 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grm1P97772 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grm1P97772 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Grm1P97772 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Grm1P97772 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Grm1P97772 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Grm1P97772 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Grm1P97772 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Grm1P97772 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grm1P97772 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grm1P97772 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grm1P97772 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Grm1P97772 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grm1P97772 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grm1P97772 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grm1P97772 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grm1P97772 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grm1P97772 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grm1P97772 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Grm1P97772 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Grm1P97772 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Grm1P97772 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.4 ms