Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2cP97760 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2cP97760 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr2cP97760 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2cP97760 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2cP97760 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2cP97760 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms