Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3f3aP84244 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H3f3aP84244 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H3f3aP84244 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3f3aP84244 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3f3aP84244 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3f3aP84244 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3f3aP84244 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3f3aP84244 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3f3aP84244 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3f3aP84244 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H3f3aP84244 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3f3aP84244 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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