Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rit1P70426 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rit1P70426 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rit1P70426 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rit1P70426 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rit1P70426 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rit1P70426 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rit1P70426 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rit1P70426 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rit1P70426 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rit1P70426 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rit1P70426 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rit1P70426 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rit1P70426 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rit1P70426 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rit1P70426 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rit1P70426 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rit1P70426 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rit1P70426 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rit1P70426 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rit1P70426 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rit1P70426 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rit1P70426 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rit1P70426 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms