Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Frat1P70339 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Frat1P70339 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Frat1P70339 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frat1P70339 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Frat1P70339 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Frat1P70339 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frat1P70339 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frat1P70339 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frat1P70339 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frat1P70339 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frat1P70339 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frat1P70339 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frat1P70339 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frat1P70339 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frat1P70339 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frat1P70339 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms