Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb4bP68372 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb4bP68372 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tubb4bP68372 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb4bP68372 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubb4bP68372 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb4bP68372 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb4bP68372 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tubb4bP68372 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb4bP68372 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms