Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Psmc6P62334 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psmc6P62334 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psmc6P62334 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Psmc6P62334 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Psmc6P62334 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Psmc6P62334 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psmc6P62334 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psmc6P62334 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psmc6P62334 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Psmc6P62334 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psmc6P62334 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Psmc6P62334 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psmc6P62334 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psmc6P62334 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psmc6P62334 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Psmc6P62334 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psmc6P62334 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psmc6P62334 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmc6P62334 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmc6P62334 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmc6P62334 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psmc6P62334 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psmc6P62334 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psmc6P62334 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psmc6P62334 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psmc6P62334 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psmc6P62334 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psmc6P62334 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Psmc6P62334 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms