Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm5P62322 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm5P62322 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lsm5P62322 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lsm5P62322 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lsm5P62322 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm5P62322 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms