Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2d1P61080 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ube2d1P61080 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d1P61080 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2d1P61080 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2d1P61080 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms