Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup43P59235 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup43P59235 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup43P59235 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup43P59235 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup43P59235 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup43P59235 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup43P59235 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup43P59235 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup43P59235 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup43P59235 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup43P59235 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup43P59235 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Nup43P59235 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup43P59235 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup43P59235 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup43P59235 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup43P59235 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup43P59235 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup43P59235 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nup43P59235 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup43P59235 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nup43P59235 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup43P59235 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup43P59235 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup43P59235 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup43P59235 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup43P59235 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup43P59235 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup43P59235 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.5 ms