Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P58686 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P58686 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P58686 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P58686 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P58686 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P58686 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P58686 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P58686 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P58686 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P58686 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
P58686 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P58686 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P58686 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P58686 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P58686 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P58686 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P58686 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P58686 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P58686 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P58686 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P58686 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P58686 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P58686 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P58686 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P58686 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P58686 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P58686 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P58686 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P58686 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P58686 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
P58686 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
P58686 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P58686 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P58686 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P58686 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P58686 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P58686 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P58686 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P58686 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P58686 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P58686 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P58686 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P58686 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P58686 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P58686 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P58686 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P58686 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P58686 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P58686 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P58686 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P58686 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P58686 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P58686 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P58686 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P58686 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P58686 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P58686 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P58686 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P58686 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P58686 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P58686 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P58686 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P58686 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P58686 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P58686 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P58686 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P58686 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P58686 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P58686 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
P58686 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P58686 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P58686 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P58686 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P58686 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P58686 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P58686 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P58686 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
P58686 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P58686 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P58686 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P58686 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P58686 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P58686 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P58686 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P58686 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P58686 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P58686 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P58686 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P58686 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P58686 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P58686 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P58686 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P58686 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P58686 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P58686 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P58686 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P58686 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P58686 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P58686 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms