Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab8aP55258 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab8aP55258 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab8aP55258 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab8aP55258 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab8aP55258 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab8aP55258 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab8aP55258 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab8aP55258 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab8aP55258 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab8aP55258 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab8aP55258 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab8aP55258 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms