Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn5P54830 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn5P54830 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn5P54830 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn5P54830 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn5P54830 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn5P54830 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpn5P54830 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms