Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna1P52793 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna1P52793 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna1P52793 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna1P52793 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna1P52793 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna1P52793 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna1P52793 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna1P52793 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna1P52793 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna1P52793 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna1P52793 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna1P52793 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna1P52793 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna1P52793 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna1P52793 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna1P52793 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna1P52793 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Efna1P52793 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efna1P52793 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna1P52793 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna1P52793 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna1P52793 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna1P52793 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna1P52793 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms