Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rfx1P48377 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rfx1P48377 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rfx1P48377 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx1P48377 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx1P48377 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx1P48377 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rfx1P48377 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx1P48377 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rfx1P48377 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rfx1P48377 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rfx1P48377 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rfx1P48377 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx1P48377 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx1P48377 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx1P48377 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rfx1P48377 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rfx1P48377 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rfx1P48377 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx1P48377 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx1P48377 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rfx1P48377 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx1P48377 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rfx1P48377 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rfx1P48377 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rfx1P48377 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rfx1P48377 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rfx1P48377 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rfx1P48377 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rfx1P48377 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms