Protein–RNA interactions for Protein: P42932

Cct8, T-complex protein 1 subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8P42932 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cct8P42932 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cct8P42932 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cct8P42932 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct8P42932 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cct8P42932 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cct8P42932 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cct8P42932 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cct8P42932 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cct8P42932 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cct8P42932 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct8P42932 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct8P42932 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cct8P42932 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cct8P42932 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cct8P42932 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cct8P42932 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct8P42932 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cct8P42932 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct8P42932 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cct8P42932 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cct8P42932 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cct8P42932 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cct8P42932 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cct8P42932 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cct8P42932 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms