Protein–RNA interactions for Protein: P37242

Thrb, Thyroid hormone receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThrbP37242 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ThrbP37242 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ThrbP37242 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThrbP37242 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ThrbP37242 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ThrbP37242 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ThrbP37242 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ThrbP37242 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ThrbP37242 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ThrbP37242 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThrbP37242 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThrbP37242 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThrbP37242 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThrbP37242 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThrbP37242 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThrbP37242 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ThrbP37242 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ThrbP37242 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ThrbP37242 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ThrbP37242 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ThrbP37242 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ThrbP37242 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ThrbP37242 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms