Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ptpn11P35235 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptpn11P35235 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn11P35235 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptpn11P35235 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ptpn11P35235 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptpn11P35235 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptpn11P35235 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ptpn11P35235 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptpn11P35235 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptpn11P35235 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptpn11P35235 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptpn11P35235 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ptpn11P35235 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ptpn11P35235 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptpn11P35235 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpn11P35235 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms