Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ifnar1P33896 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ifnar1P33896 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ifnar1P33896 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ifnar1P33896 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ifnar1P33896 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms