Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nedd1P33215 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nedd1P33215 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nedd1P33215 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nedd1P33215 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nedd1P33215 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nedd1P33215 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Nedd1P33215 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nedd1P33215 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nedd1P33215 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nedd1P33215 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nedd1P33215 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nedd1P33215 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nedd1P33215 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nedd1P33215 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nedd1P33215 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nedd1P33215 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nedd1P33215 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms