Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Cdk4P30285 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Cdk4P30285 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Cdk4P30285 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Cdk4P30285 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Cdk4P30285 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Cdk4P30285 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Cdk4P30285 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Cdk4P30285 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Cdk4P30285 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Cdk4P30285 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Cdk4P30285 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Cdk4P30285 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Cdk4P30285 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Cdk4P30285 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Cdk4P30285 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Cdk4P30285 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26,39■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Cdk4P30285 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Cdk4P30285 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Cdk4P30285 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms