Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PrkcdP28867 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcdP28867 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcdP28867 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcdP28867 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcdP28867 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcdP28867 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms