Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aco1P28271 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aco1P28271 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Aco1P28271 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Aco1P28271 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aco1P28271 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aco1P28271 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Aco1P28271 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Aco1P28271 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Aco1P28271 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Aco1P28271 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aco1P28271 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aco1P28271 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aco1P28271 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aco1P28271 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aco1P28271 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aco1P28271 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Aco1P28271 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aco1P28271 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Aco1P28271 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Aco1P28271 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aco1P28271 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aco1P28271 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aco1P28271 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aco1P28271 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aco1P28271 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aco1P28271 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aco1P28271 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms