Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RdxP26043 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RdxP26043 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RdxP26043 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RdxP26043 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RdxP26043 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RdxP26043 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RdxP26043 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RdxP26043 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RdxP26043 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RdxP26043 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RdxP26043 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RdxP26043 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RdxP26043 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RdxP26043 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RdxP26043 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RdxP26043 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RdxP26043 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RdxP26043 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RdxP26043 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RdxP26043 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RdxP26043 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RdxP26043 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RdxP26043 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RdxP26043 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RdxP26043 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RdxP26043 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RdxP26043 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RdxP26043 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RdxP26043 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RdxP26043 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RdxP26043 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RdxP26043 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RdxP26043 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RdxP26043 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RdxP26043 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RdxP26043 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RdxP26043 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RdxP26043 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RdxP26043 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RdxP26043 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RdxP26043 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RdxP26043 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RdxP26043 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RdxP26043 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RdxP26043 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RdxP26043 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RdxP26043 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RdxP26043 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RdxP26043 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RdxP26043 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RdxP26043 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RdxP26043 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RdxP26043 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RdxP26043 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RdxP26043 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RdxP26043 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RdxP26043 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RdxP26043 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RdxP26043 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RdxP26043 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RdxP26043 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RdxP26043 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RdxP26043 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RdxP26043 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RdxP26043 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RdxP26043 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RdxP26043 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RdxP26043 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RdxP26043 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RdxP26043 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RdxP26043 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RdxP26043 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RdxP26043 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RdxP26043 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RdxP26043 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RdxP26043 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RdxP26043 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RdxP26043 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RdxP26043 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RdxP26043 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RdxP26043 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RdxP26043 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RdxP26043 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RdxP26043 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RdxP26043 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RdxP26043 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RdxP26043 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RdxP26043 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RdxP26043 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RdxP26043 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RdxP26043 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RdxP26043 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RdxP26043 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RdxP26043 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RdxP26043 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RdxP26043 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RdxP26043 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RdxP26043 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RdxP26043 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms