Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata3P23772 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata3P23772 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata3P23772 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata3P23772 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata3P23772 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata3P23772 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata3P23772 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata3P23772 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata3P23772 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata3P23772 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata3P23772 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata3P23772 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata3P23772 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata3P23772 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata3P23772 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata3P23772 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata3P23772 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata3P23772 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata3P23772 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata3P23772 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms