Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggta1P23336 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggta1P23336 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggta1P23336 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggta1P23336 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggta1P23336 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggta1P23336 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggta1P23336 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggta1P23336 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ggta1P23336 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggta1P23336 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggta1P23336 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggta1P23336 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ggta1P23336 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms