Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb1aP21447 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb1aP21447 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb1aP21447 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb1aP21447 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb1aP21447 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb1aP21447 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb1aP21447 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb1aP21447 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb1aP21447 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb1aP21447 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb1aP21447 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb1aP21447 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb1aP21447 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms